Viņš dzimis 1737. gadā Meksikas štatā Ozumbā un uzsācis reliģisko karjeru un divdesmit gadu vecumā ticis iesvētīts par priesteri.
Neskatoties uz filozofisko sagatavotību, viņš jau no jaunības ir nodarbinājies ar dabaszinātņu, fizikas, matemātikas un astronomijas zināšanām un pielietojumu. Savu laiku laikrakstos un žurnālos viņš publicē vērtīgus darbus par zinātniskām tēmām. Viņš ieguva starptautisku atpazīstamību un tika iecelts par atbilstošu Parīzes Zinātņu akadēmijas partneri. Viņš daudz laika pavada, veicot zinātnes eksperimentus, un apkopo plašu bibliotēku. Viņš ir arheoloģisko priekšmetu un retu augu un dzīvnieku eksemplāru kolekcionārs. Izpētiet Xochicalco. Lai godinātu viņu, 1884. gadā tika nodibināta Antonio Alzates zinātniskā biedrība, kas 1935. gadā kļuva par Nacionālo Zinātņu akadēmiju. Viņa pazīstamākais redakcijas darbs ir jezuīta Fransisko Havjera Klavijero piezīmes Meksikas senajai vēsturei. Mēdz teikt, ka viņš ir Sor Juana Inés de la Cruz tāls radinieks. Viņš nomira Mehiko 1799. gadā.
