Oaksakas iekarošana noritēja samērā mierīgi, jo Zapotec un Mixtec kungi domāja, ka viņi eiropiešos atradīs sabiedrotos, kas viņiem nepieciešami acteku sakāvei.
No otras puses, citas grupas, piemēram, Sjerras Zapotecs, Chontales un it īpaši Mixes, pretojās un veica dumpju turpinājumu. Pēc triumfa un vēl 16. gadsimtā spāņi atņēma vietējiem iedzīvotājiem savas zemes, legalizējot šo rīcību, izmantojot encomiendas, mercedes un karaļa piešķirtās šķelšanās, tādējādi jau no Spānijas iekarošanas sākuma iezīmējot nelīdzsvarotību un nevienlīdzība, kas valdītu starp Spānijas un pamatiedzīvotāju sabiedrību.
Kolonizatoru ļaunprātīgā izmantošana bija tik bagātīga, ka liela daļa abu Audiencias un vietnieka Antonio de Mendoza veikto darbu bija vērsti uz to, lai ierobežotu Valle de Oaxaca marķīza Hernán Cortés un encomenderos varu. Tādējādi viņi ierosināja stiprināt karalisko autoritāti, un tāpēc tika izsludināti Jaunie likumi (1542) un izveidota sarežģīta administrācija. Emaņģelizācijas uzdevums Mixtec un Zapotec apgabalā bija Dominikānas ordeņa darbs, kurš, galvenokārt izmantojot pamatiedzīvotājus, uzcēla greznas baznīcas un klosterus vietās, kur koncentrējās lielie iedzīvotāju centri, piemēram, Antequera pilsēta, Yanhuitián un Cuilapan. .
Garīgais iekarojums bija radikālāks un vardarbīgāks nekā militārais iekarojums. Lai saglabātu kontroli pār iedzīvotājiem, iekarotāji ar modifikācijām uzturēja noteiktas pamatiedzīvotāju struktūras tā, ka dažiem Oaksakas ielejas un Mixteca Alta priekšniekiem izdevās saglabāt senās privilēģijas un īpašumus; Tā vietā, lai pievērstu Amerikas tautas kristietībai, misionāri centās iznīcināt jebkādas pirmsspāņu pasaules reliģijas pēdas.
Neskatoties uz vietējo iedzīvotāju demogrāfisko samazināšanos, ko izraisīja epidēmijas un slikta izturēšanās, 16. gadsimts bija ekonomiska izaugsme, pateicoties jaunu metožu, kultūru un sugu ieviešanai. Piemēram, Mixteca labā peļņa tika iegūta, izmantojot zīdtārpiņus, liellopus un kviešus. Pilsētu tirgus un raktuvju attīstība veicināja šo izaugsmi.
Tomēr šo labklājību pārtrauca problēmas, ar kurām kalnrūpniecība saskārās kopš 1590. gada. Tirdzniecība starp Seviļu un Ameriku samazinājās, un iedzīvotāju skaita samazināšanās dēļ samazinājās pilsētu patēriņš, un darbaspēks tika samazināts līdz minimumam.
Septiņpadsmitajā gadsimtā ekonomiskā depresija bija tad, kad tika definētas koloniālās struktūras, tika nostiprināta dominēšanas shēma un izveidoti atkarīgas ekonomikas mehānismi. Monopola un centralizētas tirdzniecības shēmas piemērošana kavēja reģionālo ekonomisko attīstību, liekot tik bagātiem apgabaliem kā Oaksakas ieleja orientēt savu ekonomiku uz pašpietiekamību, neskatoties uz kakao, indigo un košeīna ražošanas un tirdzniecības nozīmi. .
Jau septiņpadsmitā gadsimta otrajā pusē Jaunās Spānijas ekonomika sāka uzlaboties: kalnrūpniecības ražošana atsākās, tirdzniecība ar Centrālameriku un Peru atkal tika atļauta, un pamatiedzīvotāji sāka atjaunoties. Šajā laikā spāņi, kas dzīvo Miksekā un Oaksakas ielejā, sevi veltīja liellopu audzēšanai lielās proporcijās, un haciendas veiksmīgi apvienoja kviešu un kukurūzas ražošanu ar liellopu audzēšanu. Koloniālā ekonomika tika pārstrukturēta laikā no 1660. līdz 1692. gadam, liekot pamatus Apgaismības gadsimtam.
Jaunā Spānija aug un plaukst apgaismības laikmetā. Teritorija dubultojas, iedzīvotāju skaits trīskāršojas, bet ekonomiskās produkcijas vērtība - sešas reizes. Labākais šo sasniegumu piemērs ir kalnrūpniecība, kas ir centrālā ekonomiskā ass, kas, lai arī joprojām bija verdzībā, no 3 300 000 peso darba 1670. gadā līdz 27 000 000 peso 1804. gadā.
Jaunās Spānijas bagātība izpaužas intensīvā celtniecības aktivitātē un baroka krāšņuma pārplūšanā, tieši tad Antequera viņi cita starpā uzcēla Santodomingo baznīcas Rožukrona kapelu, Sv. Soledad, San Agustín un Consolación.
18. gadsimts bija politisko un ekonomisko reformu modernizācijas gadsimts, kuru veica Burbonas karaļi.
Līdz 1800. gadam Meksika bija kļuvusi par ārkārtas bagātības, bet arī ārkārtējas nabadzības valsti, lielākā daļa iedzīvotāju bija piesaistīti haciendām un komūnām, pret viņiem slikti izturējās darba vietās, verdzināja raktuvēs un dzirnavās, bez brīvības, bez naudas. un bez jebkādas iespējas uzlabot.
Spāņi pussalā monopolizēja politisko un ekonomisko varu; Šādi sociālās, ekonomiskās un politiskās nevienlīdzības apstākļi uzkrāja spriedzi un neapmierinātību. No otras puses, tādu notikumu kā Francijas revolūcija, Amerikas Savienoto Valstu neatkarība un Anglijas rūpnieciskā revolūcija ietekme satricina amerikāņu sirdsapziņu un kreolos sāk veidoties Jaunās Spānijas neatkarības ideja.
